Kiedy główny kapitał korporacji S wpłaca pieniądze do firmy, istnieją bardzo różne konsekwencje podatkowe w zależności od tego, czy płatność jest uważana za pożyczkę, czy zaliczana do dodatkowej wpłaty kapitału wpłaconego. Spłaty pożyczki od korporacji S na rzecz kapitału zasadniczo nie są uznawane za dochód na rzecz kapitału. Jeżeli jednak początkową wypłatę uznano za dodatkowy wpłacony kapitał, kolejne wypłaty na poczet kwoty głównej można uznać za wypłaty dywidendy lub wynagrodzenia, które następnie podlegają opodatkowaniu na poczet kwoty głównej i mogą nawet obejmować podatki na własny rachunek.
Aby spłata kwoty głównej na rzecz korporacji S była właściwie traktowana jako pożyczka, wewnętrzna służba skarbowa lub IRS wymaga istnienia dobrej umowy długu między korporacją S. a mocodawcą. Jeśli taka umowa nie istnieje, pożyczka może zostać uznana przez IRS za dodatkowy kapitał wpłacony. Elementy umowy długu działającej w dobrej wierze obejmują takie elementy, jak:
1) Pisemna umowa lub weksel własny między korporacją S. a mocodawcą
2) Rozsądna stopa procentowa pobierana od pożyczki
3) Pewien rodzaj zabezpieczenia pożyczki
4) Harmonogram spłat pożyczki
Nadrzędnym tematem tego ustalenia jest prawdziwa umowa pożyczki, w której pożyczkodawca, który w tym przypadku jest również zleceniodawcą, ma wszystkie normalne zabezpieczenia zewnętrznego pożyczkodawcy. Jeśli takie zabezpieczenia nie istnieją, fundusze można uznać za „zagrożone”. Jest to to samo, co w przypadku każdej innej inwestycji lub wkładu w przedsiębiorstwo. Z punktu widzenia korporacji S odbiór funduszy głównych powinien być klasyfikowany jako dług tylko wtedy, gdy istnieje prawdziwa umowa długu. Jeśli nie, otrzymane środki powinny być domyślnie rejestrowane jako dodatkowy wpłacony kapitał.
Ponieważ przedsiębiorstwa S są podmiotami przepływowymi, wpływ podatkowy dochodu lub straty netto działalności ujmuje się w poszczególnych deklaracjach podatkowych zleceniodawców. Zleceniodawcy są odpowiedzialni za śledzenie ich osobistych zapasów i długów w firmie. Straty przejściowe korporacji można odliczyć tylko do wysokości podstawy kapitałowej każdej z nich. I odwrotnie, dochód z tranzytu przez korporację S przekraczający podstawę uznaje się za dochód do opodatkowania. Chociaż sama korporacja S nie jest odpowiedzialna za śledzenie stanu zapasów i zadłużenia swoich właścicieli, powinna nadal wyraźnie określać wkłady kapitałowe z pożyczek, aby sprawozdania finansowe na koniec roku były prawidłowe. Wszelkie błędy w sprawozdaniach finansowych spółki S mogą spowodować, że K-1 wydane właścicielom akcji będą nieprawidłowe. Niezwykle ważne jest również, aby istniała wyraźna komunikacja między kierownictwem korporacji S a zleceniodawcą wpłacającym lub pożyczającym pieniądze korporacji.
